新任教育部長吳茂昆傳出曾赴中國多所大學講課，引發爭議。對此，國民黨團書記長李彥秀今天(17日)表示，兩岸學術正常交流是國民黨鼓勵的政策，但相關標準應該要一致，吳茂昆具有諸多爭議，是否適任教長值得討論；民進黨團書記長許智傑則說，誠實最重要，雖然短期講座與違法兼職不同，但吳茂昆應該先自己說明清楚。

新任教育部長將由中研院院士、東華大學前校長吳茂昆出任。但吳茂昆傳出曾赴中國大陸多所大學講課，甚至還曾擔任中國國務院下中科院顧問，引發爭議。
對此，國民黨團書記長李彥秀17日表示，兩岸學術正常交流是國民黨鼓勵的政策，但相關標準應該要一致，吳茂昆對於整體國民教育沒有清楚的擘畫藍圖，過去國與國關係的意識型態非常明顯，擔任校長期間還有諸多爭議，究竟是否適任值得討論。她說：『(原音)到底赴大陸學術交流的標準如何設置，我們期待吳部長自己上任後19日到教委會時應該對外交代說明清楚。』
國民黨立委柯志恩也說，吳茂昆應該是百年來上任前爭議最多的教育部長，不管吳茂昆有沒有踩到紅線，政府都應該趁此把紅線界定，否則未來台海兩岸專家不知赴中標準在哪。
對於吳茂昆赴中爭議，民進黨立委也呼籲吳茂昆對外說明清楚。民進黨團書記長許智傑說，吳茂昆應該像內政部長葉俊榮一樣把赴中情況說明清楚，誠實最重要。他說：『(原音)盡快講，我覺得沒什麼好隱瞞的，趕快講清楚。有赴中兼課、講課的辦法，你長期兼課是不允許的，短期講座是可以接受的，應該要老實講，不要讓教育部去查。』
民進黨團副幹事長吳思瑤也說，短期學術講課並不違法，但若是兼職就構成違法，所以短期學術講課與違法兼課兼職不同，大家不要混為一談，不過當事人應先釐清相關問題。